1. מחסנים אוטומטיים יכולים לחסוך עבודה וקרקע. מכיוון שהמחסן האוטומטי מאמץ שיטות בקרה מתקדמות כגון מחשבים אלקטרוניים ועגורני ערימת כבישים בעלי יעילות גבוהה, יעילות הייצור של המחסן שופרה מאוד. לעתים קרובות מחסן גדול צריך רק כמה עובדים, חוסך הרבה עבודה. . במקביל, גם העבודה במחסן צומצמה מאוד, ותנאי העבודה שופרו. המדפים רבי הקומות של המחסן האוטומטי יכולים להשתמש בשטח באופן סביר, כך שניתן להגדיל את כמות הסחורות המאוחסנות לכל שטח קרקע ליחידה. באותו שטח קרקע, יכולת האחסון של בניית מחסן אוטומטי היא מספר פעמים או אפילו פי עשרה מזו של בניית מחסן רגיל. בדרך זו, עם אותו נפח אחסון, המחסן האוטומטי חוסך הרבה קרקע.
2. פעולות הכניסה והיציאה האוטומטיות של המחסן מהירות ומדויקות, וזמן הפעולה מתקצר. מחזור הסחורות המודרני דורש מהיר ומדויק. בשל השימוש בשיטות בקרה מתקדמות ובמכונות הפעלה, מחסנים אוטומטיים משתמשים במהירות ובמרחק המהירים ביותר והמרחק הקצר ביותר כדי לספק סחורות, מה שמקצר מאוד את הזמן לסחורות בתוך ומחוץ למחסן. יחד עם זאת, שיעור דיוק הפעולה של המחסן גבוה, והמחסן יכול לתאם באופן אורגני עם יחידת האספקה והמשתמשים, מה שתורם לקיצור זמן ההפצה של סחורות.
3. לשפר את רמת הניהול של המחסן. מכיוון שהמחסן האוטומטי הנשלט על ידי מחשב אלקטרוני מבטל את שיטת הניהול הידנית המשותפת והמורכבת של הספר הראשי, ניהול החשבון של המחסן וכמות גדולה של נתונים מאוחסנים דרך המחשב, וניתן לקרוא לו בכל עת בעת הצורך, וזה לא רק מדויק, אלא גם נוח לניתוח מודיעין. במונחים של מלאי, המחסן האוטומטי יכול לשלוט במלאי ברמה החסכונית ביותר, ואת המלאי של המחסן האוטומטי ניתן למזער בתנאי של השלמת אותו מחזור הסחורות.
4. מחסנים אוטומטיים תורמים לאחסון סחורות. במחסן אוטומטי, ישנם סחורות רבות המאוחסנות בכמות גדולה ובמגוון זנים. בשל השימוש במערכת המדף למגש, הסחורה נמצאת במגש או בקופסה, מה שהופך את פעולת הטיפול לבטוחה ואמינה, ומונע את התופעה של אריזות פגומות ואריזה רופפת. למחסן האוטומטי יש ביצועי איטום טובים, המספקים תנאים טובים להתאמת הטמפרטורה במחסן ולשיפור האחסון והתחזוקה של סחורות. מצויד במכשירי אזעקה ומערכות ניקוז במחסנים אוטומטיים, המחסן יכול למנוע ולכבות שריפות בזמן.